Funkcje biologiczne

 0    59 flashcards    dominiksura
download mp3 print play test yourself
 
Question język polski Answer język polski
Co to ECM?
start learning
macierz zewnątrzkomórkowa - kompleks różnych białek tworzących szkielet zapewniający utrzymanie kształtu i sprężystości tkanek
Co zawiera ECM?
start learning
1. PROTEOGLIKANY i GAG 2. BIAŁKA WŁÓKNISTE 1. KOLAGEN 2. ELASTYNA 3. FIBRONEKTYNA 4. FIBRYLINA 3. BIAŁKA NIEWŁÓKNISTE 1. LAMININA 2. ENTAKTYNA 3. TENASCYNA
Kolagen struktura I rz.
start learning
(Gly-X-Y), dużo proliny, glicyny, hydroksyproliny, hydroksylizyna(glikozylacja)
Kolagen struktura II rz
start learning
trzy łańcuchy skręcone w lewoskrętną helisę kolagenową (3,3 reszty), superskręcone prawoskrętnie (odporność na odwijanie przez rozciąganie)
Kolagen struktura III rz
start learning
podstawowa jednostka - tropokolagen, utrzymywana przez wiązania wodorowa,
Rodzaje kolagenu
start learning
tworzące włókna: I, II, III tworzące sieci: IV, VIII kolageny towarzyszące IX i XII
Biosynteza kolagenu
start learning
s
Dojrzewanie kolagenu
start learning
Utlenianie lizyny do formy aldehydowej - allizyna i kondensacja poprzeczna łańcuchów (aldolowa)
Po co są peptydy ekstensyjne (telopeptydy)?
start learning
Umożliwiają tworzenie superhelisy poprzez dużą ilość reszt cysteiny (bez udziału enzymów)
Czym różni się elastyna od kolagenu?
start learning
Umożliwia powrót komórki do stanu początkowego, mało hydroksyproliny, brak hydroksylizyny
Cytoszkielet funkcje
start learning
Ruch komórek, podział komórkowy, apoptoza, transport wewmętrzny
Filamenty aktynowe (mikrofilamenty)
start learning
zbudowane z aktyny globularnej (G), po połączeniu jest to już aktyna fibrylarna (F) i z białek wiążących aktynę (ABP), które umożliwiają polimeryzację(zależną od ATP), depolimeryzację, stabilizację, usieciowanie, łączenie ze strukturami
Mikrotubule
start learning
zbudowane z alfa i beta-tubuliny, a centra polimeryzacji to gamma-tubulina, w przekroju poprzecznym mają 13 protofilamentów, polimeryzacja opiera się na czapeczce-GTP
Filamenty pośrednie
start learning
keratyny, laminy jądrowe, desminy, wimentyny, perferyny i neurofilamenty
Cechy białek globularnych
start learning
dobrze rozpuszczalne, zwarta struktura, stabilizujące oddziaływania hydrofobowe i hydrofilowe
Łańcuchy hemoglobiny i mioglobiny
start learning
mioglobina ma jeden łańcuch alfa, a hemoglobina cztery 2x alfa i 2x beta
Wiązanie tlenu przez mioglobinę
start learning
żelazo 2+ w hemie, histydyna proksymalna - związana z hemem i histydyna dystalna wiążąca O2
Dlaczego hemoglobina jest rozwiązaniem systemowym?
start learning
Ze względu na kooperatywne wiązanie i uwalnianie tlenu (pozwala dostarczać więcej tlenu) co związane jest z sigmoidalnym wykresem powinowactwa do tlenu, oraz hemoglobina ma możliwość wiązania dwutlenku węgla
Wiazanie tlenu w hemoglobinie
start learning
Po związaniu podjednostki przesuwają się względem siebie co powoduje przejście do stanu R (relaxed) - wcześniej nieutlenowana jest T. Forma R ma większe powinowactwo innych hemów do związania tlenu
Modele wiązania kooperatywnego
start learning
model jednoprzejściowy - wszystko w R(wiązanie tlenu) lub wszystko w T(dysocjacja), model sekwencyjny - po kolei każdy hem
Allosteryczne regulacje wiązania hemoglobiny
start learning
2,3-bisfosfoglicerynian - stabilizuje formę T hemoglobiny, produkt glikolizy, spadek pH zmniejsza powinowactwo, obecność CO2 przekształcany do karbaminianu co powoduje przejście do stanu T
Hemoglobina płodowa
start learning
zawiera 2x alfa i 2x gamma, nie wiąże 2,3-BPG, ma większe powinowactwo do tlenu
Hemoglobina w leczeniu cukrzycy
start learning
HbA1c - jest glikozylowana nieenzymatycznie i jej duże stężenie jest w dużym stężeniu cukru
Cechy centrum aktywnego enzymu
start learning
trójwymiarowa szczelina odosobniona od środowiska, zajmuje stosunkowo małą objętość enzymu, wiąże substrat przez bardzo wiele słabych oddziaływań, precyzyjne dopasowanie atomów, kształt może się zmieniać
Aminokwasy w centrum aktywnym
start learning
kontaktowe: wiążące substrat, katalityczne pomocnicze: właściwie orientują substrat
Teorię oddziaływania substrat-enzym
start learning
model klucza i zamka, indukowanego dopasowania, teoria odkształcenia substratu
Rodzaje katalizy
start learning
kowalencyjna(cysteina, seryna, histydyna), kwasowo-zasadowa(specyficzna-tylko H3O lub OH, ogólną), poprzez odkształcenie wiązania(by strain)
Jak enzymy zmniejszają energię aktywacji
start learning
stabilizacja stanu przejściowego, likwidacja niekorzystnych oddziaływań ze srodowiskiem, alternatywny szlak przejścia, zmniejszanie entropii
Km, kkat, Vmax
start learning
stała michaelisa...
Linearyzacja Lineweavera-Burke
start learning
y=1/v x=1/s
Rodzaje inhibicji
start learning
nieodwracalna, odwracalna: kompetencyjna(rośnie Km), niekompetencyjna(rośnie Vmax), akompetencyjna(łączy się tylko do kompleksu ES, zmniejsza Km i Vmax), mieszana
Allosteria
start learning
zmiana powinowactwa chemicznego białka do wiązanych cząsteczek poprzez zmianę jego struktury przestrzennej
Enzymy allosteryczne
start learning
często składają się z wielu jednostek, miejsce wiązania efektorów jest inne niż wiązanie substratu, nie działają zgodnie z Michaelisa tylko mają wykres sinusoidalny
Izoenzymy
start learning
różnią się sekwencją aminokwasową, katalizują tę samą reakcję, pozwalają modulować metabolizm
Kontrola aktywności enzymatycznej
start learning
zmiana tempa degradacji, regulacja ekspresji, modyfikacje kowalencyjne, allosteria, inhibicja
3 Etapy sygnalizacji komórkowej
start learning
1. Odebranie sygnału 2. Przekazanie sygnału 3. Odpowiedź komórki
Rodzaje sygnalizacji komórkowej
start learning
1. Bespośrednia-jukstakrynna. 2. Z udziałem cząsteczek: a) endokrynna, neuronalna-daleka b) parakrynna i autokrynna - miejscowa
Rodzaje efektów sygnalizacyjnych
start learning
1. Szybki zmiana w funkcji białek już istniejących. 2. wolny - zmiana ekspresji genów
Rodzaje ligandów
start learning
Hydrofilowe - zewnątrzkomórkowe, hydrofobowe - wewnątrzkomórkowe
Funkcje kaskad sygnalizacyjnych
start learning
przekazywanie, wzmocnienie(amplifikacja), integracja, rozprowadzenie i sprzężenie zwrotne
Przełączniki molekularne
start learning
fosforylacja i białka wiążące GTP (białka G i monomeryczne białka G)
Regulacja transdukcji sygnału
start learning
Na poziomie ścieżek - amplifikacja, specyficzność, terminacja, tworzenie kompleksów sygnalizacyjnych. Na poziomie białek: regulacja syntezy, aktywności, degradacji, cięcia proteolityczne, lokalizacja białek
Tworzenie kompleksów sygnalizacyjnych
start learning
1. przy aktywnym receptorze (p-Tyr) 2. oddziaływania z białkiem rusztowania (scaffold protein) 3. dokowanie do reszt fosfoinozytolowych w błonie
Wyłączenie sygnailzacji
start learning
1. Zmniejszenie stężenia ligandu. 2. Sekwestracja receptora. 3. Degradacja receptora. 4. Inaktywacja receptora. 5. Inaktywacja białka w kaskadzie 6. Negatywne sprzężenie zwrotne 7. Krzożowa inhibicja różnych szlaków
Rodzaje receptorów błonowych
start learning
1. jonotropowe - kanały jonowe 2. metabotropowe - współpracują z białkami G 3. o aktywności katalitycznej
Charakterystyczne domeny umożliwiające oddziaływania - tworzące kompleks sygnalizacyjny
start learning
SH2 - rozpoznanie pTyr SH3 - rozpoznanie domen bogatych w Pro PH - interakcja białkowo-lipidowe PTB - rozpoznanie pTyr po B-turn
Kinazy rodzaje
start learning
białkowa kinaza A (zależna od cAMP), białkowa kinaza C (zależna od Ca), receptory o aktywności kinaz tyrozynowych, kinazy serynowo-treoninowe, kinazy fosfatydyloinozytoli, fosfolipazy
Przykłady receptorów jonotropowych
start learning
receptory waniloidowe - wrażliwe na temperaturę, receptor acetylocholiny, receptory PIEZO - wrażliwe na dotyk
Receptory metabotropowe, serpentynowe
start learning
połączone z białkami G, przechodzą 7 razy przez błonę komórkową
Najważniejsze enzymy docelowe dla białek G
start learning
cyklaza adenylowa, fosfolipaza C
Kaskada zainicjowana przez światło
start learning
aktywacja białka G, fosfodiesteraza, produkcja GMP
Aktywacja fosfolipazy C prowadzi do
start learning
DAG (aktywującego kinazę białkową c) oraz IP3 aktywujące kanały Ca
RTK (receptory o aktywności kinazy tyrozynowej) mogą aktywować następujące szlaki
start learning
Fosfolipazę C, kaskadę kinaz MAP, szlak PI
Co zostaje fosforylozowane w szlaku JAK/STAT
start learning
Kinaza tyrozynowa JAK fosforyluję STAT(który jest jednocześnie czynnikiem transkrypcji)
Grubość błony biologicznej wynosi
start learning
6nm
Jeżeli dwukrotnie spadnie potencjał na błonie mitochondrialnej to syntaza ATP będzie
start learning
hydrolizować ATP
Białko Ras jest
start learning
monomerycznym białkiem G, aktywnym z GTP
Wtórnym przekaźnikiem jest
start learning
cAMP, cGMP, DAG, IP3
Najbardziej rozpowszechniona rodzinna receptorów
start learning
metabotropowe, serpentynowe

You must sign in to write a comment